На 31 август 2018 г. в 10:34 часа, самолет CESSNA 680 с регистрационни знаци TC-OYD, без пътници, с двама пилоти и стюардеса на борда, изпълнява полет от Баку за Бургас. Полетът е изпълнен без особености до самото приземяване. Няколко секунди след опирането на бетонната писта, по време на изтъркалването, ВС започва да се отклонява вдясно от централната линия. Опитите на двамата пилоти да го задържат в рамките на ПИК са безуспешни. В резултат самолетът напуска ПИК в района на централната пътека за рулиране „С“, излиза на грунда, преминава през бетонов постамент с аеронавигационно оборудване и спира на тревната площ между перона и пистата. Екипажът не е пострадал, но на ВС са нанесени повреди в лявата носова част на тялото и по носовия колесник, като е разрушен силовият възел за закрепването му към самолета.
На 22.05.2021 г. самолет A320-214 с регистрационни знаци LZ-FBC изпълнява полет № FB-8509 по маршрут от София до Шарм Ел Шейх. Двигател № 1 на самолета отказва 10 минути след излитане от летище София. Екипажът на ВС изключва двигател № 1 и се връща на летището в София. Кацането на летище София е нормално, без последствия за екипажа пътниците и самолета.
На 5 август 2020 г. самолет A320-232, регистрационни знаци HA-LWH, експлоатиран от авиационен оператор „Wizz Air Hungary Ltd“, се подготвя за полет от София (LBSF) до Дортмунд (EDLW). По време на финалната фаза на наземното обслужване, извършвани от наземния оператор „Goldair Handling“, след качване на пътниците на борда водачът на моторна стълба започва маневра за отделяне на стълбата от самолета и напускане на местостоянката. Докато маневрира около самолета, моторната стълба с платформата си удря лявото полукрило на самолета на около 0,5-0,6 m от края на крилото. Нанесените повреди на ВС не позволяват изпълнението на полета. ЕВС, пътниците и наземния персонал не са получили наранявания. Изпълнението на полетната задача е прекратена, а пътниците са върнати на терминала.
На 26 февруари 2018 г. при условия на ниски температури и снеговалеж, след повече от 6 часа престой на перона и последващи процедури за противообледителна обработка на три самолета тип A321-231 на авиационен оператор „Wizz Air“ по време на излитане и набор на височина се появяват колебания в показанията на приборите измерващи скоростта. Поради тази причина два от самолетите (регистрационни знаци HA-LXP и HA-LXD) кацат принудително на летище Будапеща, а трети (регистрационни знаци HA-LXL) прекратява излитането си от летище София.